根據醫院的規模、性質和處理污水排放去向，進行工藝選擇。傳染病醫院必須采用二級處理，并需進行預消毒處理；處理出水排入自然水體的縣及縣以上醫院必須采用二級處理；處理出水排入城市下水道(下游設有二級污水處理廠)的綜合醫院采用二級處理，對采用一級處理工藝的必須加強處理效果；對于經濟不發達地區的小型綜合醫院，條件不具備時可采用簡易生化處理作為過渡處理措施，之后逐步實現二級處理或加強處理效果的一級處理。

江蘇專科醫院污水處理設備
此裝置一般埋設于地表之下，運用二次生物接觸氧化處理工藝，它處理的效果超越全混合生物氧化池，對水質的適應性強度高，保證了水處理的穩定性。該設備在池中采用了新型強效彈性立體填料，對污水中的有機物質具有強效去除的功能。該設備通過氧化處理之后，產生的污泥量較少，僅需90天排放一次即可。為了避免放生病菌滋生、傳播的現象發生，必須對水質進行深度消毒處理。目前應用多的消毒工藝有：紫外線消毒、二氧化氯消毒、臭氧消毒。醫院需根據污水水質特點及排放量進行選擇。
醫院污水處理設備特點
 1、埋設于地表以下，設備上面的地表可作為綠化或其他用地，不需要建房及采暖、保溫。
2、 二級生物接觸氧化處理工藝均采用推流式生物接觸氧化，其處理效果優于*混合式或二級串聯*混合式生物接觸氧化池。并比活性污泥池體積小，對水質的適應 性強，耐沖擊負荷性能好，出水水質穩定，不會產生污泥膨脹。池中采用新型彈性立體填料，比表面積大，微生物易掛膜，脫膜，在同樣有機物負荷條件下，對有機 物去除率高，能提高空氣中的氧在水中溶解度。
3、生化池采用生物接觸氧化法，其填料的體積負荷比較低，微生物處于自身氧化階斷，產泥量少，僅需三個月(90天)以上排一次泥(用糞車抽吸或脫水成泥餅外運)。
4、該地埋式生活污水處理設備的除臭方式除采用常規高空排氣，另配有土壤脫臭措施。
5、整個設備處理系統配有全自動電氣控制系統和設備故障報警系統，運行安全可靠，平時一般不需要專人管理，只需適時地對設備進行維護和保養。
江蘇專科醫院污水處理設備

醫療機構污水處理排放的標準如下：
1.醫院、衛生院、醫療機構需要執行《醫療機構水污染排放標準》GB18466-2005中的標準。
2.醫療機構污水處理的程度，主要是根據污水的排向而定，本著安全、環保、節能、減排、增效的基本原則，選擇技術前瞻、工藝可靠、工程投資經濟、處理效果穩定、處理流程簡化、運轉費用經濟、操作管理簡單的污水處理工藝。
3.綜合醫療機構（縣級或20張床位以下和其他所有醫療）機構，無論排放到何處，要求必須經消毒處理后方可排放。可以采用的裝置有虹吸式二氧化氯消毒裝置以及自動同步雙虹吸醫院污水消毒裝置。

地埋式醫院污水處理設備使用與安裝
 1、基礎：如放置在地坪以上，只需準備一塊與設備外形相同的混凝土地坪作為基礎。基礎承壓必須大于4T/m2，也同時要求水平、平整。如設備埋于地坪以下，基礎標高必須小于或等于設備標高并保證下雨不積水，基礎一般是素混凝土(是否配筋視當地地質情況而定)。
2、安裝：根據安裝圖就位，各箱體依次就位，箱體的位置、方向不能放錯，互相間距必須準確，并連接好管道。在設備內注入清水，檢查各管道有無滲漏，若無則箱體四周覆土，直至設備檢查孔，并平整地面。把電控箱控制線與水泵接通，電控箱與電源接通，接線時注意風機、電機的轉向，必須與風機所指方向相同。

目前常用的消毒劑主要是臭氧、二氧化氯、CIO2和次氯酸鈉等。
消毒方法比較：氯（Cl）具有持續消毒作用；工藝簡單，技術成熟；操作簡單，投量準確。產生具致癌、致畸作用的有機氯化物(THMs)；處理水有氯或氯酚味；CI腐蝕性強；運行管理有一定的危險性。消毒效果能有效殺菌，但殺滅病毒效果較差。
次氯酸鈉（NaOCl）無毒，運行、管理無危險性。缺點產生具致癌、致畸作用的有機氯化物(THMs)；使水的pH值升高。效果與Cl2殺菌效果相同。
二氧化氯(ClO2)具有強烈的氧化作用，不產生有機氯化物(THMs)；投放簡單方便；不受pH影響。運行管理方便，省勞動力。缺點只能就地生產，就地使用。優點較Cl2殺菌效果好。
紫外線無有害的殘余物質；無臭味；操作簡單，易實現自動化；運行管理和維修費用低。電耗大；紫外燈管與石英套管需定期更換；對處理水的水質要求較高；無后續殺菌作用。效果好，但對懸浮物濃度有要求。
臭氧(O3)有強氧化能力，接觸時間短；不產生有機氯化物；不受pH影響；能增加水中溶解氧。臭氧運行、管理有一定的危險性；操作復雜；制取臭氧的產率低；電能消耗大；基建投資較大；運行成本高。殺菌和殺滅病毒的效果均很好。